Sonic Rivals

Le jeu commence lorsque le Docteur Eggman transforme Tails, Amy Rose, Rouge et l'Émeraude Mère en cartes à l'aide de son nouvel appareil. Sonic et Knuckles arrivent sur les lieux et découvrent ce qui s'est passé. Knuckles, déterminé à sauver l'Émeraude Mère, explique à Sonic qu'il est hors de question de faire équipe et qu'il doit atteindre Eggman en premier. Sonic ricane et répond qu'il aime les bons défis.

Pendant ce temps, Shadow the Hedgehog reçoit un signal de détresses émis par Eggman. Soudain, un mystérieux hérisson nommé Silver surgit du futur. Silver est alors poursuivi par Shadow. Lorsqu'ils se font face, Silver informe Shadow qu'il doit lui aussi atteindre Eggman en premier. Après de multiples affrontements, il s'avère que ce Docteur Eggman est en réalité Eggman Nega, et que le véritable Docteur Eggman a lui-même été enfermé dans une carte avant le début de l'histoire. Après un ultime combat contre Sonic, Knuckles, Shadow et Silver, Nega est vaincu, tout le monde retrouve sa forme d'origine, et Silver repart vers le futur en emportant Eggman Nega, désormais piégé dans une carte.